一、二級生物安全實驗室為普通實驗室，技術(shù)要求相對不高。三、四級生物安全實驗室(以及研究非本土動物病原體的BSL-3級實驗室)由于從事高危害性微生物研究，具有嚴格的技術(shù)要求。為了防止，污染環(huán)境和感染、傳播疾病，此類實驗室要求處于完全的隔離無害狀態(tài)。從防護的角度出發(fā)，關鍵是處理好空氣的隔離和排水的無害化。實驗室內(nèi)一般沒有不同級別的防護區(qū)，每個防護區(qū)具備合理的壓力梯度以杜絕防護區(qū)間空氣互相串通，一般是從外到里，壓力遞減。就技術(shù)措施而言，防護區(qū)間空氣的隔離容易實現(xiàn)，但對于排水的無害化要求，則由于排水系統(tǒng)二相流的特性和消毒的復雜性不太容易做到。因此，在三、四級生物安全實驗室排水系統(tǒng)設計中，必須采取安全、可靠、完善和合理的技術(shù)措施以保證防護區(qū)域內(nèi)排水的無害化，實現(xiàn)安全防護。要達到這一目的，首先要求三、四級生物安全實驗室排水系統(tǒng)獨立設置(如無條件獨立設置則要求進行無害化處理)；其次要求每個防護區(qū)域內(nèi)水氣流不能互相串通；再次是所有源自防護型實驗室、用于清除污染的傳遞間和浴室、衛(wèi)生間大便器的排水以及防護區(qū)內(nèi)II級及以上生物安全柜的污水，在最終排往下水道之前，必須經(jīng)過凈化消毒處理。簡而言之設計的關鍵點在于通氣隔離和排水消毒。
在排水系統(tǒng)設計中，要想隔絕排水管內(nèi)的氣流互竄是通過排水支管上設存水彎的水封作用來實現(xiàn)。但存水彎在使用過程中有可能因以下原因造成存水彎的水封被破壞。即：
(1)負壓抽吸；?
(2)正壓噴濺；
(3)自虹吸；
(4)水封高度不夠；
(5)長時間不用水封內(nèi)的水蒸發(fā)等水封被破壞；
(6)慣性晃動。
為防止水封不被破壞就要向排水管內(nèi)補充空氣，使水流暢通，減小氣壓變化幅度，可采取以下措施：
(1)安裝通氣管；
(2)安裝排水止回閥；
(3)安裝吸氣閥；?
(4)水封高度加高；
(5)經(jīng)常向存水彎補水；
(6)增加密閉蓋。
此外大便器排水管設計的不合理，也會造成相鄰其他排水設施水封被破壞，發(fā)生氣流互竄。
大便器的排水是不穩(wěn)定的非均勻流(大便器的支管上更為明顯)，在短時間內(nèi)會形成水躍，使水面壅起，瞬間充滿管道斷面，流速增加，動能亦增加。一定時間后水面下降，流速下降。故在短時間內(nèi)會發(fā)生壓力變化。
根據(jù)國家標準GB6952-2005《衛(wèi)生陶瓷》要求，坐便器沖水距離≥12M，市場上有的水平噴射距離超過18米。也就是說18米的管道內(nèi)都有可能發(fā)生壓力變化。當不同防護要求的其他排水設施與大便器共用一套排水橫管時，彼此間至少要保持大于18米的距離。在工程上，這一距離有時難以保證。因此，為徹底防止氣流互竄，在四級的生物安全實驗室防護區(qū)內(nèi)的大便器排水應單獨排出。
排水的無害化，首選加熱消毒(高壓滅菌)法。
在實驗室核心工作區(qū)內(nèi)應設置不排蒸汽的高壓蒸汽滅菌器。對三、四級生物安全實驗室一般常用的是專用雙扉高壓滅菌。雙扉高壓滅菌器既可以是下排氣式，也可以是預真空式，其特點是高壓滅菌器有兩道門，能確保滅菌過程中所產(chǎn)生的廢水、冷凝水、廢氣等在排放之前進行安全滅菌處理。
下排氣式高壓滅菌器是蒸汽在壓力作用下進入滅菌器，由上而下置換較重的空氣并通過滅菌器的排氣閥排出。
預真空式高壓滅菌器可以在蒸汽進入前使空氣從滅菌器排出，并且可以在134℃下進行，通常一側(cè)處于相對污染區(qū)，另一側(cè)處于相對清潔區(qū)。滅菌器的排水可在污染區(qū)一側(cè)，也叮以在清潔區(qū)一側(cè)排放(由工藝專業(yè)確定排放位置)。
雙扉高壓火菌器具運行時的蒸汽經(jīng)設備的熱交換器做冷卻處理后，以水狀態(tài)排水。瞬間排水最高溫度可達100℃最大流速為2.62m3/h。如排水點設在污染區(qū)，為了防止病毒的泄漏，一般直接連接在室內(nèi)排水管上。由于瞬間排水有溫度高、瞬時流速快的特點，在鄰近火蔭器排水點的其它排水的水封容易破壞，熱氣從管子里往外冒，為了避免此現(xiàn)象，建議單獨設排水管。當排水點設在清潔區(qū)時，叮采用間接排水，降溫后排地漏。
污水在排出前，還需將pH值調(diào)至中性。
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